三十五年正月甲申朔，李远至藁城，果遇德州贼将都指挥葛进领马步一万余为前锋，步兵过滹沱河，远乘其半渡，率所部进击之。贼见远军少，敛退下骑，系于林间，步来接战。远佯却，贼来追，乃分兵潜出其后，纵其马，遂奋击之。贼退已失马，遂大败，斩首四千余级，溺水死者甚多，获马千余匹，葛进仅以身免。捷至，上以玺书劳远曰：“将军以轻骑八百，出奇应变，破贼万人，功亦伟哉！万古名将不能过也。所部将士能奋忠效力，建功于岁首，宜加褒宠，前锋交战都指挥下及军校皆升一级。”戊子，遣都督朱能率轻骑一千哨至衡水县，遇贼哨兵，与战，斩首七千余级，获马五百余匹，生擒指挥贾荣等。乙未，师由馆陶渡河，上见一病卒卧于地，命以所乘从马载之，左右曰：“从马病卒岂得乘之？”上曰：“人命至重，马岂贵于人乎？今病卒不能行，不以马载之，则遂弃之耳。战用其力，病而弗顾，是爱人不如爱马也，宁辍马以乘之，卒既获济，马复何损？”将士闻之，莫不感悦。 丁酉，至旧县，攻拔其城，斩首三千余级，生擒其守将。戊戌，攻拔东平，擒指挥詹璟。庚子，攻拔汶上，擒都指挥薛鹏。
辛丑，上饬将士曰：“孔子之道，如天之高，如地之厚，如日月之明，参赞化育，师表万世，天下非孔子之道无以为治，生民非孔子之道无以得安。今曲阜阙里在焉，毋入境，有犯及一草木之微者，杀无宥。邹县孟子之乡，犯者罪如之。”庚戌，攻拔沛县。癸丑，大军至徐州。（“大”字下原有一“将”字，据明天一阁抄本删。）
二月甲寅朔，不闻贼军消息，上遣胡骑指挥款台领十二骑，马皆有副，回觇消息。款台至邹县，遇贼运粮军三千余人，款台等鸣锣大啖，驰入其阵，呼曰：“大军且至，不降者死。”贼众奔溃，遂擒千户二人而归。知贼军至济宁，上曰：“款台以十二骑而破贼军三千，诚壮士也。宜纪其勋，以俟升赏。”甲戌，驻营于徐州东北，贼坚壁不敢出。上欲移军南行，诸将曰：“各营军士多出取粮，今起营，恐有后至者，城中遥见，出兵掩袭，非便也。”上曰：“卿等无虑，我以计破贼，要使一人行，贼不敢轻犯。”乃伏兵于九里山，先藏百余骑于演武亭，令数骑来往城下诱之，且戒之曰：“尔等在城下解鞍息马，示以安闲，若贼不出，谩骂以挑之，贼必怒而逐，尔可按辔徐行，引其渡河，即举炮，我放兵驰击之，贼众必惧，急回渡河，怆惶之顷，必成擒矣。”数骑如上旨往来城下，贼不敢出。乃焚其庐舍，大骂之，徐发一矢射城上，至暮则去。明日，复如是。贼不胜愤，果开门以兵五千追而渡河，炮响伏发，上以数骑出西门断其归路，腹背夹击之。贼众奔溃，急争桥，桥坏，堕水死者千余人，斩首三千余级，余贼兢奔入城。后单骑往来城下，贼竟不敢出矣。己卯，上戒将士以外祖徐王之乡，坟在是，禁毋侵扰，违者不宥。遣都指挥李让致祭于徐王坟，以钞万锭赐王亲族。
三月甲申朔，大军自徐州趋宿州。上语诸将曰：“贼蹑我后，（“蹑”原作“虽”，据明天一阁抄本改。）吾欲攻而破之，要使贼心目眩乱，不知所出。”乃留都指挥金铭将游骑哨景山，戒之曰：“贼军且至，见尔孤军，必来追袭，尔列队徐行，乍进乍退，贼疑尔为诱，必不敢进。我令都指挥冀英先将数骑隔河按伏，觇尔渡河，贼来追蹑，英即举炮，必疑有伏，乘其狐疑，众已渡矣。”铭在后，果遇贼兵万余，逡巡进退，引军临河，贼众来追，冀英连放数炮，贼即欲退，欲布阵，（原无“欲”字，“布”原作“步”，据明天一阁抄本补、改。）众皆纷乱，铭遂渡河来会宿州。后贼见无多兵，惟铭百骑，深悔失计。上曰：“贼堕吾计矣，指日可以擒之。” 辛卯，大军至蒙城。 壬辰，驻营涡河，谍知贼将平安领马步四万为前锋。上曰：“今贼来蹑我后，以计致之，不劳力而收效。会河林树丛茂，堤岸深隘，贼疑有伏，淝河川平树少，贼必不疑，可以按兵。”上命汉王守营，亲率精骑二万人，持糗糒三日，至淝河按兵，（“按”原作“接”，据明天一阁抄本改。）去大军百余里。上敕军士彩炬，列之于道，属于大军营。戒候者曰：“纵火者与贼大战也，一火举，余燎相应，贼见必以为大军，则胆落矣。若小战胜贼，火不必举也。”按甲数日，俟贼不至，粮且尽，诸将咸请回军。上曰：“更待一二日，贼必至。”明日，诸将又请曰：（原无“曰”字，据明天一阁抄本补。）“即今马无刍藁，士无粮食，是未遇敌而先自困也。”固请回军。上曰：“贼引众远来，锐意求战，彼谍知大军南行，必袭我后。若败其前锋，则贼众夺气，譬之利兵，挫折铓锷，其刃自钝。我按甲于此，以待贼至，姑少待之。”日暮，令胡骑指挥款台领数骑往哨。是夜四鼓，款台回报，贼军离淝河四里下营，已闻其更鼓声，旦必至。上曰：“贼入吾彀中矣。”黎明，胡骑都指挥白义、王真，都指挥刘江各将百骑以迎之，戒之曰：“尔等各将兵，缘路按伏，贼若驻兵不动，先以十余骑掠其营而过，侮詈以挑之。若贼来追，慎勿与战，尔且引却，渐与所伏兵合。贼惩前日不追金铭之失，必穷力来逐。尔等亟回，引入我伏内，彼急追二十余里，人马疲乏，折箠以笞之，贼众成擒矣。”上又令王真等缚草置囊中，若束帛状，载马上，遇贼来追，则弃之于地。日午，王真等与贼遇，贼将平安语其众曰：“此游骑也，亟击之，勿使得脱，毋蹈景山之悔。”乃舍步卒，率骑兵疾驰来追。王真等佯走，弃马上物于地以诱之，贼众见之，果来追，兢取所弃物，急奔二十余里，入我伏内。伏发，贼众大惊，欲回走，马皆疲敝，策之不动，皆下马罗拜请降。时平安以骑兵三千驻北岸高坡，上以数十骑当之。火耳灰者，我旧胡骑指挥也，因前取赴京师，为贼裨将，素号骁勇，持矟直趋上前，相拒十余步，胡骑都指挥童信引弓射之，中其马，马踣，火耳灰者坠跌，遂生擒之。其麾下哈三帖木儿亦骁勇，见火耳灰者被擒，持矟冲突来救，复射其马，人马仆，并擒获之。时欲生致平安，安已变服以数骑走。余贼奔遁，上率兵追之，斩首数千余级，获马八十余匹，生擒贼骁将林帖木儿，（“骁”原作“骑”，据明天一阁抄本改。）降者皆遣之。时诸将叩头贺且谢曰：“臣等自今不复更料事，如臣所言，则失此机会，罪无所逃。”上笑而谕之曰：“卿等谋非不善，而事或有相乖，无苦自贬抑，但有所欲言即言之，勿惩偶不中而遂默，安危与卿等同之。”诸将皆稽首而退。释火耳灰者等，令其带刀宿卫，左右谏曰：“此虽旧人，素号骁勇，久居贼中，其心难测，不宜置之左右。”上曰：“非尔所知，彼皆壮士，况有旧恩，今复生之，必知所报，毋用怀疑。”遂以水耳灰者为都指挥，哈三帖木儿为百户。
甲辰，遣胡骑都指挥薛脱欢领军哨宿州，击破贼军，斩首五百余级，降者释之。丙午，上语诸将曰：“我师深入，利于速战，今贼兵驻宿州，积粮为持久计，若扰其饷道，贼众饿窘，不战自溃。”命都指挥刘江将兵三千往徐州断贼粮道，趑趄不进，上怒，欲斩之，诸将叩头固请，乃得释。别遣都指挥谭清领兵百余骑断贼粮道。清至徐州，遇贼运粮军，即击败之，斩首无算。循河而南，（“循河而南”，“而”原作“西”，据明天一阁抄本改。）至淮河五河，缘水陆烧贼运粮船车不可胜计。清骑回至大店，遇贼军，清骑少，贼众围之，清且战且行。上遥见清旗帜，即引兵驰援之，出入贼阵，斩杀数十百人。火耳灰者从上出入，手杀十余人以自效。贼势披靡，清引众突围而出，与上骑兵合而击之，大败贼众，杀死无算。贼渐移兵，欲南遁，上以骑兵蹑其后，行止常距十余里。
丁未，遣都督陈文、李远哨淮河，击败贼守淮河军，斩首千余级，获马五百余匹，几夺浮桥。
丙寅，大军缀贼至小河。上语诸将曰：“贼势窘迫，必求一战，我据险以待之，使进则搤其吭，退则拊其背，不日之内，贼可擒矣。”乃令都督陈文、内官狗儿断水为桥，先渡步军辎重，骑兵随之，桥当冲要，守之可以困贼。丁卯，贼军布阵十余里，（“布”原作“步”，据明天一阁抄本改。）张左右翼，缘河而东，上率骑兵与战，贼骑败走，步军复来争桥，陈文杀败之，追奔渡河，后军来援，陈文战役，贼众皆过桥布阵。汉王帅都督张武、内官狗儿领虎贲士自林间突出击之，与上骑兵合，大败贼众，斩首二万余级，溺水死者不可胜计，尸填于河与桥平，人马皆乘尸而走，生擒贼将丁粮、朱彬。贼军据桥南，我军据桥北，相持数日，贼粮尽，卒采野菜而食。上曰：“贼众饿甚，今与相持，彼居南岸，便其馈饷，更一二日，运粮稍集，贼众得济，难以破之。”乃留守桥千余人不动，潜移大军辎重东行，去贼军三十里，夤夜渡河而南，绕出贼后。贼始不知，翼日乃觉，引军复来相对。甲戌，大军驻齐眉山，与贼大战，自午达酉，两无胜负，各领军还营。明旦，贼领众遁，会大雾，贼迷所向，旋绕山麓，日午，雾散，上引兵追袭，不十里，已及之，贼众大惊，遂掘堑自守。贼所至掘堑筑垒，或通宵筑掘，将成，明旦起行，遂弃而往，虚劳人力，士卒苦不能堪，故遇战即败。上行师不垒壁，但分布队伍，列戟为门，敌不敢犯，故军士常得安闲，人人自便。每驻营，辄与诸将驰猎以观地势，（“与”原作“语”，据明天一阁抄本改。）或有所获，悉推与将士。每拔一城，破一垒，府库所藏，皆以颁赐，故将士乐于为用。
乙亥，诸将请曰：“今我军深入，与贼相持，盛夏行师，兵法所忌，况淮土蒸湿，暑雨又作，我军畏热，傥生疾疫，非我之利。今小河东平野多牛羊，二麦将熟，粮食充足，择地驻营，休息士马，观衅而动，万全之道也。”上曰：“卿等所见，拘以常算，非知通变者也。夫两敌相持，贵进忌退，今贼众屡败，心胆俱丧。况粮道匮乏，士有菜色，日夜待哺，众志荡离，亡在旦夕。我所以引其南来者，贼军多南士，久劳于外，孰不思家？若大败之后，各归故土，岂复能合。一渡小河，懈我士心。矧贼粮饷已达淮河，相去不远，藉使得济，其气复振，难以久持。乘彼饿疲，截粮道，可以坐困，不战而屈之。我军深入，利已在我，不可少缓，容贼为计。”诸将言多二三，惟朱能、郑亨言合上意。上曰：“有欲渡河者从左，不从者右。”有数人立于右，余皆左立，独王忠立于中，上怒曰：“欲渡河者，任其所之。”于是诸将无敢复言。
丙子，上语诸将曰：“贼粮且至，虑我扰之，必分兵往护，其半坚壁自守，因其兵分势弱，我大军殚力事之，贼力不支，必弃粮而溃，营中若出为援，我乘破竹之势，贼有土崩之患。”乃遣朱荣、刘江等领轻骑往截饷道，戒之曰：“若贼众，尔等且战且行，以挠其力，慎勿与鏖战。渐近，可驰来报。”时贼将何福等欲移军就粮，上率大军与贼相连缀，昼则令游骑扰其樵采，夜则使勇士劫其营，贼众不得休息，饥疲日甚，乃分兵护粮，上亦不解甲者数日矣。 丁丑，贼众移营灵壁。己卯，都督朱荣来报，贼运粮者五万，平安率马步六万护之，结为方阵，负粮者居中，去其营二十里。上命虎贲士万人绝贼壁，间遮贼援，命汉王伏马步数万林间，俟贼战疲，突出击之。上亲率大军往逆之，贼众来接战，以骑兵夹击之，左右驰射，矢注如雨，贼人马辟易。纵步军横贯其阵，断而为两，运粮者皆弃而走，贼阵大乱，斩首万余级，乘胜追击，杀死并降者复万余人，尽获其粮饷军资器械。何福等出壁来援，虎贲士与战，稍引却，汉王率众突击之，上还兵掩击其后，贼腹背受敌，力不能支，遂大败，俘斩无算，获马伍千余匹。何福等以余众走入营，塞壁坚守。是夜，谋为遁计，上见其塞垒门，语诸将曰：“贼塞门者何也？”诸将曰：“固守以待援也。”上曰：“不然，贼欲凿壁多危突门，夜坠之而出，冲劫我营而遁，须慎防之。”已而获贼谍者，言果如上所料，严兵待之，贼不敢出。庚辰，先是，何福等与我事相对，深沟高垒，欲运粮实其中，为持久计。至是军败，粮食不给，军心离散，乃下令期明旦闻炮声三震，即突围出走，约聚于淮河就粮。辛巳，上以大军攻其壁，令汉王率诸将先登，军士闻之，即蚁附而上，我军三震炮，贼众误为己炮，急趋门走，门塞不得出，营中纷扰，人马悉从壁上乱投而下，须臾濠堑皆平，遂破其营。生擒贼将左副总兵都督陈晖、右副总兵都督平安、右参将都督马溥、都督徐真、都指挥孙成等三十七员，内官四员，礼部侍郎陈性善、大理寺丞彭与明，钦天监副刘伯完、指挥王贵等一百五十员，获马二万余匹，降者无算，尽散遣之，皆欢声动地曰：“太平太平，吾属自此获安矣！”何福单骑脱走。初，破贼壁，上屡传令不许杀人，杀人者就令偿命，由是将土不敢妄杀。壬子，遣都指挥费献等送陈晖等回北平。
五月癸未朔。 己丑，大军至泗州，指挥周璟初等率众以城来降，上问景初曰：“未攻城而先降，何也？”景初曰：“此有僧伽神最灵，臣等祷于僧伽神曰：‘降与守孰吉？’夜梦僧伽神告臣曰：‘兵临城，速降则吉，不降凶。’是以即降。上曰：“人心之灵，妙于万物，尔先觉，故神亦告。”升景初等爵各有差。是日，上谒祖陵，涕泣曰：“横罹残祸，几不能见陵寝。荷祖宗神灵，相佑予躬，今日得拜陵下，霜露久违，益增感怆。”时父老诣军门来见，赐以牛酒钞，慰劳而遣之。
辛卯，贼将盛庸领马步数万，战舰千艘，列于淮河南岸，我军列于北岸，与贼相对。上命军士舣舟缚筏，扬旗鼓噪，指麾若将渡河。贼彷徨〈&~RX;戚〉蹜，手足无措。上命丘福、朱能、狗儿等将骁骑数百人，西行二十里，泛小舟潜济。贼初不觉，渐近贼营，遂举炮。贼惊动，福等率众径突其阵，贼众投戈弃甲而走。盛庸股战不能上马，舍骑而趋，足不成步，几为我军所擒。其下掖而登舟，遂单舸脱走。乃尽获其战舰，济师，驻于南岸。是日克盱眙。
癸巳，上召诸将图所向，或曰：“先取凰阳，则彼援兵路绝，遣师径趋滁州，以取和州，集船渡江，别遣一军，西捣庐州，直出安庆，则长江之险已为我有。”或曰：“先取淮安为根本，次下通、泰、高邮，以迄真、扬，得此可以渡江，无后顾之虞。”上曰：“凤阳虽当冲要，其楼橹坚完，所守既固，非攻不下。然皇陵所在，大军屯驻，恐震惊陵寝。淮安高城深池，积粟既富，人马尚多，攻之不下，旷日持久，力屈威挫，援兵四集，非我之利。今乘势鼓行，直趋扬州，径指仪真，两城单弱，可招而下。既得真、扬，则淮安、凤阳人心自懈，我耀兵江上，聚舟渡江，东取镇江，连收常州，并举苏、松以及江浙，西下太平，抚定池州，迤于安庆，则江上孤城，粮断援绝，岂能独守？必有内变，吾于此时索取奸恶，事穷势迫，无能复匿之者，必有缚献军门者矣，（“必有缚献军门者矣”，原无“者矣”，据明天一阁抄本补。）吾得之而甘心焉，以报父皇之仇，雪围逼之耻，保社稷于几危，拔诸王于困苦，可指日收效。如诸公言，是或一道，未免迂远。”诸将稽首顿服。
乙亥，遣都指挥吴玉招谕扬州。先是，扬州卫指挥王礼闻大军将至，议欲举城来降，镇守指挥崇刚、御史王彬执王礼等系狱。至是，吴玉来招谕，礼弟王宗与千户徐政、张胜率舍人吴麟等数十人出王礼等于狱，执指挥崇刚、御史王彬，开门出降。庚子，大军至天长，王礼等缚崇刚、王彬赴军门来见，上曰：“尔等心怀忠义，执缚奸党。全城来降，尔意既厚，吾报尔亦必不薄。”上至扬州，升王礼等为都指挥同知，其余秩有差。遂命王礼同都指挥吴庸等率马步数百人谕下高邮、通、泰诸城，并集舟以备渡江。壬寅，高邮等指挥王杰等率众来降，升杰等为都指挥同知，余以差受秩。
上振旅江北，时诸奸恶皆求出城，谋为苟活计，都城空虚，上下震悚。允炆乃下罪己之诏，遣人四出征兵。苏州知府姚善献言云：“有蕴文武才略可济急危者，置之散地不用，今事势狼狈，宜速招之。”问其人为谁，不言其名。再三询之，乃曰：“黄子澄也。”议将召用，方孝孺从中沮之。既而复召，久不见至。方孝孺憾曰：“宋齐丘何不来耶？”其意指黄子澄也。方孝孺乃谋曰：“事已急矣，可用计使缓之。曷遣人许以割地，少延数日，我倚长江之险，舟楫非北军所长，速往东南召募壮丁，决战江上，胜败未可知。”允炆善其言，乃遣庆成郡主渡江至军，（原无“军”字，“成”原作“城”，据明天一阁抄本补、改。）上见郡主恸哭曰：“父皇陵土未干，我兄弟已见残灭，忍心如此，其何以堪？我不图更有今日，（“不”原作“初”，据明天一阁抄本改。）今与郡主相见，有如再世。”郡主闻上言，泣下沾襟，悲不能止。上问：“周、齐二王安在？”郡主言：“前蒙遣书欲复各王爵，周王方得召还，但未复王爵，仍拘之。”上曰：“荼毒我兄弟至此极耶！”言讫，益歔欷不胜。郡主徐以割地讲和为请，上曰：“吾受命皇考，封建茅土，且不能保，割地岂其本心哉？此奸恶缪计，欲以见欺，焉可为信？我此行在诛奸恶，以清朝廷，奠安社稷，保全骨肉，事已，欲得故封幸矣，余非所望也。”郡主语塞，乃劳遣其还，上谓郡主曰：“好语诸弟妹，久不相见，欲得少叙天伦之乐，未知能如所愿否？幸自爱。”时方孝孺延颈以望。谓其计必行。及郡主归云不从，（原无“云”字，据明天一阁抄本补。）乃失色。人问其计安出，扬大言曰：“长江可当十万兵，江北船已遣人尽烧之矣。北来军士，岂能飞渡？况天气蒸热，易以染疾，不十日，彼自退。若渡，祇送死耳，何足以当我舟师。”其言缪妄，识者笑之。
六月癸丑朔，都指挥吴庸等集高邮、通、泰船于瓜州。甲寅，上祭大江之神，祝曰：“予为奸恶所迫，不得已起兵御祸，誓欲清君侧之恶，以安宗社。予有厌于神者，使不得渡此江，神鉴孔迩，昭格予言。”乙卯，誓于众曰：“群奸构乱，祸我家邦，扇毒逞凶，肆兵无已。予用兵御难，以安宗社，尔有众克协一心，奋忠鼓勇，摧坚陷阵，斩将搴旗，身当矢石，万死一生，于今数年，茂功垂集，在戮力渡江，剪除奸恶，惟虑尔众，罔畏厥终，偾厥成功。夫天下者，我皇考之天下，民者皇考之赤子，顺承天休，惟在安辑。渡江入京，秋毫毋犯，违予言者，军法从事。于乎！惟命无常，克敬其常，尔惟懋敬，乃永无咎。”先是，贼将盛庸驻军于高资港，缘江上下二百余里，尽列海船严备。至是，上率师渡江，舳舻相接，旌旗蔽空，戈矛曜日，金鼓震地，微风飘扬，长江不波，乘潮而渡，若履平地。缘江备御海船军士，遥望皆惊愕不敢动。渐近岸，盛庸整阵以待，上麾前锋鼓噪先登，继以精骑数百直冲盛庸军，（“继以”原作“先”，据明天一阁抄本改。）贼众震慑，奔溃上山，弃戈甲而走，追奔数十里，斩首数百余级，盛庸单骑遁，海船将士皆解甲释胄来降，人升二级。
戊午，诸将言欲径薄都城，上曰：“镇江为咽喉之地，若城守不下，往来非便，譬之人患疥癣，虽不致伤生，终亦为梗。先取镇江，断其右臂，则彼势危矣。”众唯唯。上令所降海船皆悬黄旗于上，往来江中，镇江城上遥见旗帜皆变，惊曰：“缘江海船已降。”于是指挥童俊等率众来降，升俊为都指挥佥事，其余降者俱升一级。庚子，大军驻龙潭。上顾望钟山，怆然下泪，诸将请曰：“今祸难垂定，何以悲为？”上曰：“吾异日渡江入京，既见吾亲。比为奸恶所祸，不渡此江数年，今至此，吾亲安在？钟山孝陵在焉，瞻望云霄，有怀考妣，是以悲耳。”诸将闻上言，皆感泣数行泪下。
辛酉，允炆知缘江海船皆已降，又闻镇江降，忧郁不胜，徘徊于殿廷之门。方孝孺称疾不起，遣人强之问以计，孝孺曰：“今城中尚有胜兵二十万，城高池深，粮食充足，尽撤城外民舍，驱民入城，足以为守，城外积木，悉运入城。”允炆从其计，乃役军民商贾及诸色人匠，日夜拆屋运木，（原无“屋”字，据明天一阁抄本补。）盛暑饥渴，死者相枕籍，劳苦不胜，嗟怨之声盈路，咸引领以望上至，曰：“何不速来，以解我劳苦。”城外积木既多，疲于搬运，纵火焚之，连日不息。先是，城崩，役军夫修筑，将成，而他处复崩，连连不已。军民运砖土，累月不得休息，怨曰：“此去不远，何不便来？来则有此而登，我即解散，胡使我劳苦至此极耶？更迟来数日，我皆为鬼矣。”民之望上以解倒悬，甚于饥渴。
方孝孺复言：“前遣郡主未能办事，今以诸王分守城门，遣曹国公、茹尚书、王都督往龙潭，仍以割地讲和为辞。以觇其虚实，且待援兵至，选精锐数万，内外夹击，决死一战，可以成功。设有不利，即轻舸走蜀，收集士马，以为后举。”允炆然其计，乃遣李景隆、茹常、王佐至军门。李景隆等见上俯伏，汗流侠背，不敢仰视。上曰：“勤劳公等至此，雅意良厚。”李景隆等再三叩头，不能发一语。久则以割地讲和为请，上叹曰：“公等今为说客耶？始者未有衅隙，欲屠灭诸王，加我大罪，遂削除名爵，贬为庶人，以兵围逼，云以大义灭亲，必欲绝我宗祀，今日救亡不暇，何用割地为？况割地无名，我皇考定天下，一以传于子孙万世，畴敢分之？裂土割地，此亡国之绪耶，孰主张是，其罪当诛。今来为安社稷，保骨肉，复父皇之仇，能悉缚奸恶，付诸法司，使得数其罪而诛之，以谢孝陵，释天人之怒，整肃朝纲，徐听指挥，俾回故疆，实出望外，岂可以土地见啖也。（“岂可以土地见啖也”，“啖”原作“陷”，据明天一阁抄本改。）我不即入城者，正为此耳。”乃遣李景隆等归。李景隆见允炆，以上语对，允炆曰：“不欲割地，计将安出？”李景隆曰：“必得所罪者，然后可以退师。”乃令李景隆再出城，且言：“有罪者俱窜逐，今无在城，请退师，后执来献。”用是往返以稽其事。李景隆等不敢出，请拘留京诸王偕行。
癸酉，诸王来见，上怆然曰：“吾为奸恶所逼，危如累卵，今幸见骨肉，奸臣谋为不轨，欲次第见倾，若落彀中，则覆诸弟如巢鷇耳。”诸王曰：“我等拘来在京，栗栗度日，举动得罪，幸大兄至此，宗社之灵也，我等可以少宽矣。”乃宴劳遣归。诸王归城，允炆知事急，乃骂诸奸恶曰：“事由汝辈而起，今皆弃我而去，卖我者汝辈！”惟长吁而已。
甲子。上下令禁戢军士，破城之日，不许侵掠，乃遍揭榜，（“乃遍揭榜”，“乃”原作“仍”，据明天一阁抄本改。）安抚军民。时方孝孺建议坚守不出，遣间谍齎蜡丸四出促援兵，皆为我游骑所获。乙丑，克金川门，按兵而入，城中肃然，秋毫无犯，市不易肆，民皆安堵。上虑允炆害及周、齐二王，各遣骑兵千余驰往卫之。周王初不知为大军，仓卒惶怖，已而知上遣人救之，乃喜曰：“我得生矣。”遂来见上，大哭，上亦哭，道傍观者，怆然下泪。周王曰：“奸恶屠戮我兄弟，赖大兄救我更生，今日相见，真再生也。”言讫，复痛哭不止。上慰止之，与周王并辔至金川门下马，握手相劳苦。上曰：“身遭危祸，无所容生，数年亲当矢石，濒于万死，不图重见骨肉，今与贤弟相见，皆赖天地神明，宗庙社稷，父皇母后阴翼默相，乃得至此。”周王曰：“天生大兄，戡定祸乱，以安社稷，保全骨肉。不然，则皆落奸恶之手矣。”诸王及文武群臣父老人等皆来朝。允炆欲出迎，左右悉散，惟内使数人而已，乃叹曰：“何面目复相见耶？”遂阖宫自焚。上见宫中烟起，急遣中使往救，至已死矣。出其尸于火中，上叹曰：“小子无知，乃至此乎？”
时有执方孝孺来献，上指烟焰处谓方孝孺曰：“今日使幼君自焚者，皆汝辈所为也，汝死有余辜。”方孝孺稽首折哀乞怜，遂命收之。上慰遣周王归第，分命诸将守城及皇城。是日驻营龙江，乃遣人布告天下。各据召募壮丁，闻上已克京师，皆解散。及有啸聚欲为乱者，敛戢曰：“真主已出，毋徒取灭亡耳。”
上谕京师文武臣民曰：“我皇考封建诸子，巩固邦家于万年，罔有攸斁。予奉守北藩，祗慎厥职，毋敢或怠。不图幼主昏愦，奸臣窃柄，残害骨肉，煽祸兴兵，虐戾下民，逼迫予躬，以危社稷。予不得已，以兵拯难，剪除奸凶，以宁家国。师入京城，有罪者予不敢赦，无罪者予不敢诛，恭顺上天，以行吊伐。或有小人乘间生事，擅作威福，劫夺财货，快骋私愤，虐及无辜，必杀无赦。于戏！兵以定乱安民，岂敢扰之哉？告尔有众，体予至怀。”时卒有取民履者，即斩以狥。上用兵号令严明，信赏必罚，分合应变，机智如神，临敌对阵，意思闲逸，从容自如，及至决战，气勇兼溢。然不避勤劳，与士卒同甘苦，每食，士未食不先食，遇渴，士未饮不先饮。大战数十，小战无算，必先陷阵，未尝被创。自大将而下及于旗校，悉识其能否勇怯，临阵指使，各尽其用。有先退者，辄呼其姓名，以故人人争先，（“以故人人争先”，原少一“人”字，据明天一阁抄本补。）不敢后。俘获敌将，置于左右，任之不疑，人心悦感，皆欲奋力自效。凡经营谋画，咸出上心，至于攻城略地，指授诸将成算，从上所言，无不获胜。苟有作聪明自用者，必无所成。然后叹上之神算无遗策也。故能以少胜众，不四载之间，扫除奸恶，内平祸难，奠安宗社，成克复之功。
丙寅，诸王及文武群臣请上尊号，上曰：“予始逼于难，誓救祸除奸，以安天下，为伊周之勋，不意孺子无知，自底亡灭。今奉承洪基，当择有才德者，顾予菲薄，岂堪负荷？”诸王及文武群臣咸叩头苦请曰：“天生圣人为社稷生民主，（“主”原作“者”，据明天一阁抄本改。）今天下者太祖之天下，（“今天下者太祖之天下”，原无“今”字，据明天一阁抄本补。）生民者太祖之生民，天位岂可一日而虚？生民岂可一日无主？况国有长君，社稷之福。殿下为太祖嫡嗣，德冠群伦，功施于内，威被四海，宜居天位，使太祖万世之洪基，永有所托，生民永有所赖，不宜固让，以孤天人之心。”上不许。
丁卯，诸将上表劝进曰：“臣闻锄奸去恶，式扬神明之谋；附翼攀鳞，蚤际风云之会。功光前烈，德冠中兴。 恭惟殿下文明武英，宽裕仁孝，为太祖之嫡嗣，实国家之长君，天生不世之资，民仰太平之主。（“民仰太平之主”，“主”下原有一“时”，据明天一阁抄本删。）曩奸恶逞毒肆凶，祸既覃于宗藩，几欲倾于社稷，集天下之兵以相围逼，使国中之众不能逃生。乃赫怒而提一旅之师，遂呼吸而定九州之地，战必胜，攻必取，实由天命之有归；绥斯来，动斯和，爰见人心之所在。今内难已平之日，正万方欣戴之时，宜登宸极之尊，以慰臣民之望。臣等忝随行阵，仰仗威灵，素无远大之谋，窃效分毫之力，虽不敢冀云台之图像，实欲慕竹帛之垂名，谨奉表以闻。”上不允。
戊辰，诸王上表劝进曰：
天眷圣明，宏开景运，群奸既去，宗社永安。恭惟大兄殿下龙凤之姿，天日之表，祯祥昭应于图书；尧舜之德，汤武之仁，勋业夙彰于海宇。迩者憸邪构祸，毒害宗亲，谋动干戈，几危社稷。乃遵承于祖训，聿奉行于天诛。赫一怒而安斯民，备文王礼义之勇；不四载而复帝业，经世祖中兴之功。武以剪戢，克全皇考之天下；文以经纬，聿明洪武之典章。实天命之所归，岂人力之能强？愿俯狥于众志，庶永绍于洪基。惟我诸弟，谊重天伦，情深手足，荷蒙拯溺，得遂生全。祗迓龙舆，蚤正天位，庶皇考之天下永有所托，四海之赤子永有所归，幸鉴微忱，毋频谦让。无任激切之至，谨奉表以闻。
上不允所请。是日，文武群臣复请上尊号。上曰：“昔元运衰微，四海鼎沸，强弱相噬，百姓无主。天命我皇考平定天下，以安生民，勤苦艰难，创造洪基，封建子孙，维持万世。岂意弃臣民之日，体犹未冷，而奸邪鞠凶，祸起不测，图灭诸王，以危社稷。予以病驱，志耗力疲，惟欲高枕，以终余年。奸邪一旦起兵见图，令人震慑，不知所为。群臣告予曰：‘太祖皇帝创业艰难，陵土未干，而诸王见灭，宁能束手受戮，以弃我社稷乎？’予佛徨无措，顾望求生，而天下之兵日集见逼，形势之危，犹侧立于千仞悬崖之上，而推使其下也，可为悚惧。勤苦百战，出万死一生，志清奸恶，以匡幼冲，其乃殄绝于今，（“其乃殄绝于今”，原无“其”字，据明天一阁抄本补。）遂自焚殒。群臣劝予即位，予思天位惟艰，有如幼冲，弗克负荷，几坠丕图，非虚为谦让，（“非虚为谦让”，原无“让”字，据明天一阁抄本补。）诚思皇考创业艰难，欲推择诸王有才德可以奉承宗庙者立之，主宰得人，天下之福，予虽北面，且无忧矣。”群臣稽首固请曰：“殿下德为圣人，位居嫡长，当承洪基，以安四海，虽谦德有光，复谁与让位且天命所钟，孰得而辞？殿下宜蚤践大位，使民臣有所依凭，毋逊硕肤，以虚天下之望。”上固辞，不允。
己巳，上谒孝陵，欷歔感慕，悲不能止。礼毕，揽辔回营，诸王及文武群臣备法驾，奉宝玺迎上于道，（“奉宝玺迎上于道”，原缺“上于”二字，据明天一阁抄本补。）遮上马不得行，上辞让者再三，诸王及文武群臣跽拜拥上登辇，上曰：“诸王群臣以为奉宗庙宜莫如予，然宗庙事重，予不足称，今为众心所戴，予辞弗获，用循众志。”遂诣奉天殿，即皇帝位。诸王暨文武群臣上表称贺。是日，京师人民欢声动地。初，允炆起兵时，有道士谣于途曰：“莫逐燕，逐燕日高飞，高飞上帝畿。”（“高飞上帝畿”，原无“高飞”二字，据明天一阁抄本补。）已忽不见，人不知其所谓。至是上即位，方知其言验云。
壬申，命有司备礼葬允炆，上辍正朝三日。
甲戌，上谕群臣曰：“我皇考建造洪基，垂法万世，为子孙计，思虑至周。不意幼冲信任奸回，悉更旧制，使天下臣民无所遵守。予荷天地庇佑，皇考休荫，统承天位，恪守成宪，凡皇考法制为所更改者，悉复其旧。尔群臣尚竭乃心力，弼予于治。且人之才识，所至不同，或长于此而短于彼，苟于事或有误失，则明以告予，予不汝责。若隐而不言，日久觉露，情同欺罔，法则难容。夫慎终必先谨始，省己在于存诚，始终靡愆，咎何由至。每观前代君臣不谨于始，鲜克有终。予念君臣一体，故披露赤心，叮咛告戒，尔等其钦承予意。
乙亥，各处守城及有司次第来朝。
丁丑，执奸恶齐泰、黄子澄、方孝孺等至阙下，上数其罪，咸伏其辜，磔戮于市。
上得群臣所上允炆谋策，即命焚之。有请上观者，上曰：“一时之言，不必观。”复有言：“允炆所用之人，悉宜屏斥。”上曰：“此皆我皇考数十年作养人材，岂二三载所造就？”言者又曰：“虽仍其官，不宜置之要地。”上曰：“治天下者必资贤才，天之生才以为世用，凡有才能者，随器任使，共理天工，乌得而弃之？”（自“丁丑”至“乌得而弃之”两段原在“甲戌”条前，据明天一阁抄本改在“乙亥”条下。）
七月壬午朔，有事于南郊。大赦。改元，以明年为永乐元年。